1992年9月郭燕薇校長成為基新第六任校長。 

1993年3月，擴校工程展開。擴校後，學校多了課室和特別室以開設更多科目，培養學生多方面的興趣。 

學校亦透過靈修早會、團契聚會、福音周、福音營，讓學生認識真理；同時自1990年起設立「紀律雄師」計劃，通過小組活動、山野技能訓練、軍訓等，幫助一些缺乏成就感的學生重拾自信。 

2011年9月，郭校長榮休，由翁港成先生接任校長，翁校長繼承基新優良傳統，帶領師生發展德、智、體、群、美、靈六育。在翁校長的帶領下，基新中學在學術、藝術及音樂等多方面持續發展，取得了卓越成就。

學校在翁校長和一眾專業教師團隊的群策群力下，學生學業成績每年不斷攀升，從未下滑，在公開試表現更是屢創新高，成績得到區內坊眾一致認可。面對全港適齡人口下跌的大趨勢，基新中學依然逆流而上，持續擴班，自行收生報名及中一叩門人數均大幅上升，學額競爭激烈。學校的公開試合格率和成績增值亦不斷提升，每年都有不少學生成功考入香港中文大學、香港大學和香港科技大學等知名學府。此外，學校在藝術和音樂方面也積極發展，成就斐然。基新中學的合唱團和管弦樂團每年都有不少校內、校外演出，在區內夙負盛名。

例如，學校管弦樂團曾聯同聖保祿學校舉辦聯校法國五月藝術節音樂會；管弦樂團及合唱團又會每年到迪士尼演出，同學們樂在其中，培養音樂造詣。

                        
除此之外，學校50週年音樂劇的精湛演出口碑載道，吸引了數千名小學生、家長及校友前來欣賞，盛況空前，一票難求。這些活動不僅豐富了學生的課餘生活，也加強了學校與社區之間的聯繫，帶領學校發展蒸蒸日上。